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你想知道如何健康快樂地活到一百歲嗎?我的研究就是希望解決這個(gè)問題。”
4月1日上午舉行的復(fù)旦大學(xué)第十期“浦江科學(xué)大師講壇”上,英國皇家醫(yī)學(xué)科學(xué)院院士、澳大利亞國家表型組中心主任、復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院名譽(yù)教授杰里米·尼科爾森以《表型組醫(yī)學(xué):在不斷變化且不可預(yù)測(cè)的世界中推進(jìn)疾病預(yù)防與診斷》為題做報(bào)告。
作為國際分子表型組領(lǐng)域?qū)<遥峥茽柹谙到y(tǒng)醫(yī)學(xué)、代謝表型、分子病理學(xué)等領(lǐng)域都作出了突出貢獻(xiàn),被譽(yù)為“代謝組學(xué)之父”。讓醫(yī)學(xué)從“對(duì)抗疾病”轉(zhuǎn)向“預(yù)見未來”,他致力于讓先進(jìn)醫(yī)療技術(shù)跨越實(shí)驗(yàn)室的高墻,成為每個(gè)人觸手可及的生命盾牌。
從基因組到表型組,人類如何研究“延年益壽”
“我們都希望能夠活得更長壽、更健康、更快樂,而對(duì)于我們中的很多個(gè)體來說,科學(xué)進(jìn)步可以顯著提升生命質(zhì)量,這就是我們所說的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)。”尼科爾森的演講從精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)切入,指出基因組檢測(cè)工作是目前人類疾病防治的重要工程之一。
現(xiàn)在,科學(xué)家已經(jīng)在基因組測(cè)序方面實(shí)現(xiàn)了重要進(jìn)展,2003年, 92% 的人類基因組就已成功完成測(cè)序,但人們?nèi)栽跒槭O碌?8% 的基因組測(cè)序和圖譜編制而努力。
然而,人類生活在不斷變化的環(huán)境中,基因與環(huán)境之間的動(dòng)態(tài)交互作用是理解健康與疾病的關(guān)鍵,因此,僅僅關(guān)注基因是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的,正是這一局限催生了表型組學(xué)的誕生。
“我們的基因與環(huán)境——包括吃的食物、呼吸的空氣、使用的電子產(chǎn)品、與人體共生的微生物體——都會(huì)產(chǎn)生互動(dòng),進(jìn)而影響到人類的預(yù)期壽命。研究這些內(nèi)容的范疇,就是人類表型組。”他介紹。
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所謂表型組,就是由基因、表觀遺傳、共生微生物、飲食和環(huán)境暴露之間復(fù)雜的相互作用而產(chǎn)生的一系列可測(cè)量特征,包括個(gè)體和群體的物理特征、化學(xué)特征和生物特征。表型組學(xué)聚焦于這些可測(cè)量特征的研究,是繼基因組之后生命科學(xué)的又一個(gè)重點(diǎn)方向。
“在過去幾十年間,人類死亡的方式與比例在不斷發(fā)生改變,這是表型組學(xué)重視的問題之一。”尼科爾森用倫敦四百年間的死亡數(shù)據(jù)對(duì)比進(jìn)行舉例,說明環(huán)境與人體的互動(dòng)方式——1632年,倫敦人的主要死因是感染性疾病和兒童疾病,那時(shí)分娩死亡率和新生兒死亡率都很高,但現(xiàn)在這種死因已大為減少,而一些新的死亡因素比例則開始上升。
這些數(shù)據(jù)表明,環(huán)境影響與社會(huì)背景也與健康問題密切相關(guān)。因此對(duì)于時(shí)代與社會(huì)的關(guān)注,也是表型組學(xué)的重要話題。
比如現(xiàn)在英國有50%的兒童不經(jīng)常運(yùn)動(dòng),同時(shí)大量青少年在16歲之前就開始飲酒,這些錯(cuò)誤的習(xí)慣會(huì)提升他們的炎癥風(fēng)險(xiǎn),甚至提高胰島素抵抗。“但這不是科學(xué)家能夠輕易解決的問題,還需要社會(huì)各方的合作與努力。”尼科爾森指出。
用先進(jìn)醫(yī)療技術(shù),破解健康危機(jī)的“代謝密碼”
“人類是超有機(jī)體,我們的健康密碼,不僅藏在2萬個(gè)人類基因中,更存在于100萬億個(gè)微生物基因的復(fù)雜對(duì)話里。”尼科爾森點(diǎn)明表型組學(xué)對(duì)人類健康與疾病的重要意義。
每人腸道內(nèi)1公斤微生物,其代謝產(chǎn)物可解釋8%的BMI變異,并與糖尿病、自閉癥等疾病直接關(guān)聯(lián)。此外,在COVID-19長期后遺癥患者的血液中,炎癥因子與脂蛋白紊亂共同構(gòu)成“代謝風(fēng)險(xiǎn)空間”,提示心血管與神經(jīng)退行性疾病風(fēng)險(xiǎn)激增。
上述種種“蝴蝶效應(yīng)”表明,傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)模式已經(jīng)難以應(yīng)對(duì)現(xiàn)代健康挑戰(zhàn),而表型組醫(yī)學(xué)通過“全息解碼”人體與環(huán)境的動(dòng)態(tài)交互,正為這些難題提供了全新視角。

“如果我們能實(shí)時(shí)讀取人體的化學(xué)信號(hào),醫(yī)療決策將不再依賴經(jīng)驗(yàn)猜測(cè)。”尼科爾森隨后向大家展示了其團(tuán)隊(duì)所研發(fā)的幾項(xiàng)先進(jìn)技術(shù)。
澳大利亞國家表型組中心已開發(fā)出低成本、便攜式的核磁共振NMR設(shè)備,可快速評(píng)估心血管風(fēng)險(xiǎn)甚至早期感染跡象。“就像血糖儀普及了糖尿病管理,未來這些工具將讓普通人也能掌握自己的健康密碼,”他舉例道,疫情期間發(fā)現(xiàn)的尿液生物標(biāo)志物,未來或能通過家用檢測(cè)試紙實(shí)現(xiàn)病毒早篩,防患于未然。
從實(shí)驗(yàn)室到手術(shù)臺(tái),該中心研發(fā)的i-Knife技術(shù)則通過組織蒸發(fā)氣體分析,能夠在0.1秒內(nèi)區(qū)分腫瘤與健康組織,精準(zhǔn)率超95%,避免過度切除的悲劇。結(jié)合MRI與AI,未來,手術(shù)機(jī)器人將根據(jù)代謝圖譜自動(dòng)避開神經(jīng)與血管,“像GPS一樣引導(dǎo)手術(shù)刀”,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)穿透。目前,倫敦三家醫(yī)院已對(duì)該技術(shù)開展臨床試驗(yàn),患者愈后生存率將得到明顯提高。
疾病沒有國界,國際合作是破局之路
面對(duì)生命健康領(lǐng)域的一系列全球性挑戰(zhàn),尼科爾森認(rèn)為,國際合作是唯一出路。他在PPT中展示了國際表型組中心網(wǎng)絡(luò)的藍(lán)圖——從上海到珀斯,從多哈到劍橋,科學(xué)家們將共享數(shù)據(jù)、統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),構(gòu)建全球健康預(yù)警系統(tǒng)。
“COVID-19教會(huì)我們,疾病無國界,而表型組醫(yī)學(xué)的使命是讓預(yù)防無盲區(qū)。”他強(qiáng)調(diào)。
關(guān)于中西醫(yī)協(xié)作互補(bǔ),尼科爾森指出,中醫(yī)藥承載獨(dú)特理論體系,是極具價(jià)值的預(yù)防醫(yī)學(xué)手段,而西醫(yī)更側(cè)重疾病治療領(lǐng)域,兩者形成顯著互補(bǔ)。“針對(duì)不同個(gè)體如何選擇中西醫(yī)療法”這一命題亟需深入研究。他同時(shí)強(qiáng)調(diào)科研倫理準(zhǔn)則:作為科學(xué)家,數(shù)據(jù)公開與共享是學(xué)術(shù)使命的核心,但國際合作需以知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù)為前提,需通過規(guī)模化路徑實(shí)現(xiàn)成果轉(zhuǎn)化價(jià)值。

2018年,復(fù)旦大學(xué)牽頭實(shí)施人類表型組國際大科學(xué)計(jì)劃(一期),這項(xiàng)中國首個(gè)聚焦人類表型組的國際大科學(xué)工程,由金力院士擔(dān)任首席科學(xué)家,聯(lián)合其團(tuán)隊(duì)在內(nèi)的全球頂尖科研力量,構(gòu)建了從宏觀體征到微觀分子水平的全維度表型解析體系。
“不同國家的科研工作者建立起連接與共識(shí),在研究方法、實(shí)驗(yàn)流程等方面達(dá)成一致。好比是大家都在做菜,現(xiàn)在用的是同一份菜譜,保證做出來的菜味道是一樣的。”作為國際協(xié)作組的共同發(fā)起人和理事會(huì)成員,尼科爾森這樣比喻。
該計(jì)劃近年來產(chǎn)出一系列突破性成果,顯著推進(jìn)了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展,既為生命科學(xué)領(lǐng)域樹立新標(biāo)桿,又通過跨尺度表型數(shù)據(jù)庫與標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)體系的建立,向世界貢獻(xiàn)了系統(tǒng)性的健康研究范式。尼科爾森介紹,下一步,團(tuán)隊(duì)還要克服樣本收集處理的問題,從而實(shí)現(xiàn)更深入的國際合作。
互動(dòng)環(huán)節(jié),一名學(xué)生提問:AI能參與表型組研究各個(gè)環(huán)節(jié)嗎?尼科爾森搖搖頭:“AI可以進(jìn)行大規(guī)模群體分析,但如果分析對(duì)象是差異化個(gè)體,恐怕就有點(diǎn)力不從心了,這也證明了科學(xué)家的不可替代性。”
在尼科爾森看來,AI是工具,但科學(xué)的核心是人類對(duì)未知的追問。
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